Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RIPK4P57078 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms