Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3BP55884 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms