Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NAP1L1P55209 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms