Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RABGGTBP53611 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGGTBP53611 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms