Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EFNA3P52797 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA3P52797 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms