Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAP1GDS1P52306 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms