Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 HNRNPK-209ENST00000483135 900 ntTSL 29.81□□□□□ -0.848e-8■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.615e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.045e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 AP2A2-213ENST00000528815 3072 ntTSL 218.97■□□□□ 0.635e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 GPHN-211ENST00000556020 562 ntTSL 427.43■■□□□ 1.981e-6■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 GPHN-202ENST00000459628 1723 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 GPHN-201ENST00000315266 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 GPHN-206ENST00000553936 574 ntTSL 310.78□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 GPHN-215ENST00000557654 503 ntTSL 46.35□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 GPHN-214ENST00000556633 512 ntTSL 34.43□□□□□ -1.71e-6■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 GPHN-210ENST00000555668 550 ntTSL 44.2□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.692e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 PRKCZ-210ENST00000470596 788 ntTSL 233.29■■■□□ 2.922e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 PRKCZ-205ENST00000461465 480 ntTSL 426.7■■□□□ 1.862e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 PRKCZ-221ENST00000495347 698 ntTSL 425.28■■□□□ 1.642e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.734e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.324e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 DGCR6L-203ENST00000443409 935 ntTSL 1 (best)26.05■■□□□ 1.764e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 SNX8-209ENST00000494722 590 ntTSL 229.33■■■□□ 2.293e-9■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 SNX8-204ENST00000435336 634 ntTSL 518.69■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 SNX8-205ENST00000447136 583 ntTSL 317.73■□□□□ 0.433e-9■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 KDM1A-205ENST00000494920 905 ntTSL 317.07■□□□□ 0.323e-9■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 MBTPS1-204ENST00000562886 3333 ntTSL 216.86■□□□□ 0.293e-9■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 KDM1A-203ENST00000465864 568 ntTSL 512.99□□□□□ -0.333e-9■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.73e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.683e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.783e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.513e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.683e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.653e-7■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 AC078845.1-201ENST00000445293 889 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.269e-8■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.669e-8■■■■■ 30.7
HNRNPMP52272 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.984e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.114e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.884e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 FAM156A-220ENST00000622430 576 ntTSL 420.07■□□□□ 0.84e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.774e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 FAM156A-202ENST00000610625 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.79■□□□□ 0.764e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.714e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 FAM156A-222ENST00000622732 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 418.79■□□□□ 0.64e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 FAM156A-219ENST00000622323 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.26■□□□□ 0.354e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 FAM156A-204ENST00000612083 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 416.84■□□□□ 0.294e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 FAM156A-211ENST00000616592 319 ntTSL 214.92□□□□□ -0.024e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 FAM156A-217ENST00000619897 784 ntTSL 414□□□□□ -0.174e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 FAM156A-209ENST00000615171 590 ntTSL 411.58□□□□□ -0.564e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 WNK2-205ENST00000432730 7792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)19.24■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 CYP4F3-207ENST00000592279 2078 ntTSL 225.98■■□□□ 1.755e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 CYP4F3-204ENST00000587360 559 ntTSL 425.13■■□□□ 1.615e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.455e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.025e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 CYP4F3-209ENST00000609670 337 ntTSL 317.88■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 CYP4F3-206ENST00000591058 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.375e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TBC1D15-217ENST00000550746 6184 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TBC1D15-203ENST00000462788 1995 ntTSL 1 (best)5.27□□□□□ -1.571e-6■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.661e-6■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 NF1-215ENST00000493220 5691 ntTSL 28.77□□□□□ -1.017e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.168e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 NF1-205ENST00000456735 7787 ntTSL 57.57□□□□□ -1.27e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.218e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 NF1-219ENST00000579081 8788 ntTSL 1 (best)6.03□□□□□ -1.448e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.243e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 EPM2A-225ENST00000640297 374 ntTSL 540.03■■■■■ 47e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.617e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.437e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-215ENST00000556892 474 ntTSL 532.61■■■□□ 2.817e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SLC39A9-208ENST00000556125 944 ntTSL 331.91■■■□□ 2.79e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.67e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.577e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SLC15A4-203ENST00000376740 761 ntTSL 529.8■■■□□ 2.367e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.241e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SLC15A4-206ENST00000539703 634 ntTSL 528.86■■■□□ 2.217e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.617e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.517e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 EPM2A-226ENST00000640351 1388 ntTSL 523.84■■□□□ 1.417e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 EPM2A-215ENST00000639049 3335 ntTSL 1 (best)23.8■■□□□ 1.47e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.369e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.357e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 NPTN-209ENST00000565325 858 ntTSL 223.23■■□□□ 1.317e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SLC15A4-205ENST00000535272 451 ntTSL 223.16■■□□□ 1.37e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TACC2-218ENST00000492237 438 ntTSL 523.08■■□□□ 1.297e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.277e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.277e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.277e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-208ENST00000553951 1092 ntTSL 222.66■■□□□ 1.227e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.197e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.197e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.127e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SMURF2-207ENST00000585301 1716 ntTSL 521.71■■□□□ 1.077e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.057e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TACC2-220ENST00000493951 645 ntTSL 521.47■■□□□ 1.037e-8■■■■■ 30.6
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 252.1 ms