Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK4P51957 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK4P51957 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK4P51957 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK4P51957 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK4P51957 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEK4P51957 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEK4P51957 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEK4P51957 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK4P51957 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK4P51957 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK4P51957 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK4P51957 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK4P51957 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK4P51957 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK4P51957 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK4P51957 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK4P51957 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEK4P51957 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NEK4P51957 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEK4P51957 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEK4P51957 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEK4P51957 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEK4P51957 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK4P51957 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK4P51957 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK4P51957 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK4P51957 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK4P51957 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK4P51957 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK4P51957 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK4P51957 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK4P51957 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK4P51957 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK4P51957 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK4P51957 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK4P51957 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK4P51957 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK4P51957 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK4P51957 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK4P51957 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK4P51957 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK4P51957 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK4P51957 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK4P51957 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK4P51957 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK4P51957 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK4P51957 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK4P51957 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK4P51957 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK4P51957 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK4P51957 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK4P51957 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK4P51957 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK4P51957 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK4P51957 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK4P51957 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK4P51957 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK4P51957 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK4P51957 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK4P51957 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK4P51957 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK4P51957 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK4P51957 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK4P51957 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK4P51957 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK4P51957 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK4P51957 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK4P51957 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK4P51957 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK4P51957 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK4P51957 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK4P51957 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK4P51957 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK4P51957 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK4P51957 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK4P51957 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK4P51957 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK4P51957 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK4P51957 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK4P51957 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK4P51957 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK4P51957 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK4P51957 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK4P51957 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK4P51957 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK4P51957 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK4P51957 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK4P51957 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK4P51957 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NEK4P51957 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEK4P51957 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEK4P51957 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEK4P51957 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEK4P51957 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEK4P51957 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEK4P51957 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEK4P51957 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEK4P51957 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEK4P51957 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms