Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms