Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8P50990 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8P50990 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8P50990 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8P50990 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8P50990 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8P50990 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8P50990 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8P50990 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8P50990 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8P50990 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8P50990 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8P50990 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8P50990 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8P50990 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8P50990 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8P50990 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8P50990 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT8P50990 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT8P50990 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT8P50990 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT8P50990 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT8P50990 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8P50990 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8P50990 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8P50990 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8P50990 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8P50990 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8P50990 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8P50990 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8P50990 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8P50990 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8P50990 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8P50990 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8P50990 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8P50990 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8P50990 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8P50990 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8P50990 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8P50990 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8P50990 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8P50990 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8P50990 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8P50990 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8P50990 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8P50990 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8P50990 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8P50990 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8P50990 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8P50990 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCT8P50990 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8P50990 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8P50990 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8P50990 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8P50990 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8P50990 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8P50990 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8P50990 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8P50990 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8P50990 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8P50990 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8P50990 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8P50990 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8P50990 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8P50990 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8P50990 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8P50990 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8P50990 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8P50990 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8P50990 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8P50990 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8P50990 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8P50990 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT8P50990 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT8P50990 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT8P50990 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT8P50990 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT8P50990 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT8P50990 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8P50990 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8P50990 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8P50990 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8P50990 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8P50990 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8P50990 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8P50990 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8P50990 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8P50990 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8P50990 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8P50990 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT8P50990 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8P50990 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8P50990 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8P50990 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8P50990 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8P50990 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8P50990 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8P50990 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8P50990 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT8P50990 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms