Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPT1P50897 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPT1P50897 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPT1P50897 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPT1P50897 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPT1P50897 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPT1P50897 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPT1P50897 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPT1P50897 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPT1P50897 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPT1P50897 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPT1P50897 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPT1P50897 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPT1P50897 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPT1P50897 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PPT1P50897 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPT1P50897 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPT1P50897 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPT1P50897 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPT1P50897 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPT1P50897 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPT1P50897 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPT1P50897 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPT1P50897 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPT1P50897 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPT1P50897 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPT1P50897 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPT1P50897 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPT1P50897 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPT1P50897 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPT1P50897 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPT1P50897 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPT1P50897 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPT1P50897 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPT1P50897 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPT1P50897 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPT1P50897 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPT1P50897 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPT1P50897 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPT1P50897 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPT1P50897 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPT1P50897 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPT1P50897 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPT1P50897 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPT1P50897 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPT1P50897 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPT1P50897 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPT1P50897 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPT1P50897 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPT1P50897 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPT1P50897 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPT1P50897 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPT1P50897 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPT1P50897 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPT1P50897 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPT1P50897 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPT1P50897 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPT1P50897 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPT1P50897 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPT1P50897 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPT1P50897 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPT1P50897 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPT1P50897 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPT1P50897 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPT1P50897 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PPT1P50897 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PPT1P50897 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPT1P50897 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPT1P50897 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPT1P50897 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPT1P50897 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPT1P50897 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPT1P50897 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PPT1P50897 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPT1P50897 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPT1P50897 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPT1P50897 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPT1P50897 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPT1P50897 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPT1P50897 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPT1P50897 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPT1P50897 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPT1P50897 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms