Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF6P49848 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF6P49848 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF6P49848 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF6P49848 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF6P49848 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF6P49848 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF6P49848 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF6P49848 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF6P49848 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF6P49848 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF6P49848 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF6P49848 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF6P49848 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF6P49848 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF6P49848 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF6P49848 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF6P49848 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF6P49848 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF6P49848 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF6P49848 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF6P49848 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF6P49848 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF6P49848 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF6P49848 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF6P49848 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF6P49848 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF6P49848 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF6P49848 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF6P49848 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF6P49848 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF6P49848 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF6P49848 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF6P49848 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF6P49848 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF6P49848 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF6P49848 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF6P49848 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF6P49848 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF6P49848 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF6P49848 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF6P49848 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF6P49848 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF6P49848 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF6P49848 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF6P49848 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF6P49848 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF6P49848 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF6P49848 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF6P49848 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF6P49848 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF6P49848 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF6P49848 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF6P49848 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF6P49848 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF6P49848 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF6P49848 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF6P49848 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF6P49848 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF6P49848 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF6P49848 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF6P49848 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF6P49848 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF6P49848 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF6P49848 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF6P49848 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF6P49848 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF6P49848 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF6P49848 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF6P49848 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF6P49848 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF6P49848 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF6P49848 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF6P49848 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF6P49848 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF6P49848 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF6P49848 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF6P49848 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF6P49848 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF6P49848 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF6P49848 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF6P49848 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF6P49848 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF6P49848 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF6P49848 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF6P49848 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF6P49848 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF6P49848 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF6P49848 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF6P49848 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF6P49848 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF6P49848 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF6P49848 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF6P49848 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF6P49848 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF6P49848 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF6P49848 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF6P49848 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF6P49848 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF6P49848 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms