Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARRES1P49788 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms