Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB2P49721 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms