Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP4P49662 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP4P49662 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP4P49662 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP4P49662 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP4P49662 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP4P49662 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP4P49662 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP4P49662 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP4P49662 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP4P49662 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASP4P49662 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASP4P49662 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASP4P49662 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP4P49662 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP4P49662 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP4P49662 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP4P49662 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP4P49662 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP4P49662 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP4P49662 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP4P49662 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP4P49662 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP4P49662 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP4P49662 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP4P49662 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP4P49662 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP4P49662 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP4P49662 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP4P49662 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP4P49662 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP4P49662 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP4P49662 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP4P49662 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP4P49662 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP4P49662 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP4P49662 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP4P49662 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP4P49662 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP4P49662 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP4P49662 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP4P49662 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP4P49662 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP4P49662 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP4P49662 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP4P49662 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP4P49662 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP4P49662 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP4P49662 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP4P49662 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP4P49662 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP4P49662 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP4P49662 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP4P49662 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP4P49662 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP4P49662 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP4P49662 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP4P49662 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP4P49662 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP4P49662 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP4P49662 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP4P49662 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP4P49662 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP4P49662 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP4P49662 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP4P49662 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP4P49662 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP4P49662 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP4P49662 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP4P49662 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP4P49662 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP4P49662 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP4P49662 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP4P49662 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP4P49662 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP4P49662 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP4P49662 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP4P49662 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP4P49662 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP4P49662 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP4P49662 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP4P49662 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP4P49662 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP4P49662 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP4P49662 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP4P49662 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP4P49662 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP4P49662 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP4P49662 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP4P49662 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP4P49662 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP4P49662 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP4P49662 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP4P49662 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP4P49662 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP4P49662 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP4P49662 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP4P49662 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP4P49662 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP4P49662 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms