Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RXRGP48443 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RXRGP48443 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RXRGP48443 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RXRGP48443 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RXRGP48443 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RXRGP48443 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RXRGP48443 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RXRGP48443 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RXRGP48443 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RXRGP48443 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RXRGP48443 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RXRGP48443 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RXRGP48443 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RXRGP48443 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RXRGP48443 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RXRGP48443 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RXRGP48443 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RXRGP48443 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RXRGP48443 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RXRGP48443 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RXRGP48443 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RXRGP48443 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RXRGP48443 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RXRGP48443 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RXRGP48443 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RXRGP48443 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RXRGP48443 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RXRGP48443 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RXRGP48443 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RXRGP48443 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RXRGP48443 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RXRGP48443 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RXRGP48443 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RXRGP48443 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RXRGP48443 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RXRGP48443 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RXRGP48443 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RXRGP48443 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RXRGP48443 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RXRGP48443 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RXRGP48443 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RXRGP48443 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RXRGP48443 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RXRGP48443 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RXRGP48443 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RXRGP48443 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RXRGP48443 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RXRGP48443 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RXRGP48443 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RXRGP48443 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RXRGP48443 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RXRGP48443 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RXRGP48443 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RXRGP48443 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RXRGP48443 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RXRGP48443 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RXRGP48443 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RXRGP48443 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RXRGP48443 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RXRGP48443 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RXRGP48443 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RXRGP48443 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RXRGP48443 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RXRGP48443 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RXRGP48443 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RXRGP48443 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RXRGP48443 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RXRGP48443 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RXRGP48443 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RXRGP48443 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RXRGP48443 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RXRGP48443 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RXRGP48443 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RXRGP48443 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RXRGP48443 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RXRGP48443 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RXRGP48443 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RXRGP48443 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RXRGP48443 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RXRGP48443 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RXRGP48443 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RXRGP48443 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RXRGP48443 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms