Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
UTRNP46939 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UTRNP46939 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UTRNP46939 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UTRNP46939 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UTRNP46939 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UTRNP46939 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UTRNP46939 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
UTRNP46939 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UTRNP46939 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UTRNP46939 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UTRNP46939 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UTRNP46939 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UTRNP46939 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UTRNP46939 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UTRNP46939 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UTRNP46939 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UTRNP46939 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UTRNP46939 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UTRNP46939 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UTRNP46939 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UTRNP46939 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UTRNP46939 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UTRNP46939 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UTRNP46939 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
UTRNP46939 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UTRNP46939 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UTRNP46939 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UTRNP46939 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UTRNP46939 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UTRNP46939 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UTRNP46939 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UTRNP46939 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UTRNP46939 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UTRNP46939 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UTRNP46939 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UTRNP46939 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UTRNP46939 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UTRNP46939 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UTRNP46939 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UTRNP46939 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UTRNP46939 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UTRNP46939 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UTRNP46939 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UTRNP46939 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UTRNP46939 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
UTRNP46939 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UTRNP46939 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UTRNP46939 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UTRNP46939 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UTRNP46939 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UTRNP46939 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UTRNP46939 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UTRNP46939 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UTRNP46939 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UTRNP46939 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UTRNP46939 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UTRNP46939 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UTRNP46939 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UTRNP46939 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UTRNP46939 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UTRNP46939 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UTRNP46939 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
UTRNP46939 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UTRNP46939 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
UTRNP46939 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UTRNP46939 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
UTRNP46939 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UTRNP46939 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UTRNP46939 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UTRNP46939 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
UTRNP46939 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
UTRNP46939 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
UTRNP46939 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UTRNP46939 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UTRNP46939 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UTRNP46939 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UTRNP46939 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UTRNP46939 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UTRNP46939 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UTRNP46939 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
UTRNP46939 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UTRNP46939 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UTRNP46939 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UTRNP46939 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UTRNP46939 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UTRNP46939 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UTRNP46939 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UTRNP46939 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UTRNP46939 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UTRNP46939 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UTRNP46939 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UTRNP46939 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UTRNP46939 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UTRNP46939 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
UTRNP46939 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTRNP46939 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTRNP46939 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTRNP46939 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTRNP46939 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms