Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms