Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKX2-1P43699 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms