Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA2P42262 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms