Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHAP40939 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHAP40939 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHAP40939 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHAP40939 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHAP40939 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHAP40939 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHAP40939 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHAP40939 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HADHAP40939 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHAP40939 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHAP40939 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHAP40939 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHAP40939 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHAP40939 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHAP40939 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHAP40939 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHAP40939 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHAP40939 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHAP40939 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHAP40939 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHAP40939 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHAP40939 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHAP40939 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHAP40939 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHAP40939 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHAP40939 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHAP40939 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHAP40939 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHAP40939 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHAP40939 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHAP40939 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHAP40939 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHAP40939 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHAP40939 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHAP40939 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHAP40939 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHAP40939 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHAP40939 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHAP40939 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHAP40939 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHAP40939 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHAP40939 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHAP40939 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHAP40939 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHAP40939 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHAP40939 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHAP40939 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHAP40939 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHAP40939 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHAP40939 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHAP40939 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHAP40939 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHAP40939 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHAP40939 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHAP40939 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HADHAP40939 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HADHAP40939 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HADHAP40939 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HADHAP40939 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HADHAP40939 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HADHAP40939 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms