Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFC5P40937 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFC5P40937 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFC5P40937 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFC5P40937 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFC5P40937 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFC5P40937 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RFC5P40937 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFC5P40937 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFC5P40937 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFC5P40937 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFC5P40937 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFC5P40937 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFC5P40937 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFC5P40937 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RFC5P40937 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RFC5P40937 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RFC5P40937 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFC5P40937 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFC5P40937 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFC5P40937 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFC5P40937 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFC5P40937 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFC5P40937 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RFC5P40937 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFC5P40937 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RFC5P40937 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFC5P40937 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RFC5P40937 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFC5P40937 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RFC5P40937 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFC5P40937 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFC5P40937 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFC5P40937 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFC5P40937 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFC5P40937 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFC5P40937 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RFC5P40937 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFC5P40937 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFC5P40937 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFC5P40937 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFC5P40937 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFC5P40937 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFC5P40937 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFC5P40937 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFC5P40937 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFC5P40937 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFC5P40937 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFC5P40937 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFC5P40937 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFC5P40937 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RFC5P40937 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFC5P40937 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFC5P40937 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFC5P40937 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RFC5P40937 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFC5P40937 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFC5P40937 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFC5P40937 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFC5P40937 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFC5P40937 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFC5P40937 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFC5P40937 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFC5P40937 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFC5P40937 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFC5P40937 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RFC5P40937 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFC5P40937 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFC5P40937 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFC5P40937 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RFC5P40937 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RFC5P40937 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RFC5P40937 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFC5P40937 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFC5P40937 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RFC5P40937 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RFC5P40937 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFC5P40937 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFC5P40937 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFC5P40937 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFC5P40937 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFC5P40937 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFC5P40937 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RFC5P40937 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFC5P40937 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RFC5P40937 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RFC5P40937 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFC5P40937 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC5P40937 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC5P40937 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC5P40937 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC5P40937 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC5P40937 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC5P40937 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC5P40937 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC5P40937 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFC5P40937 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFC5P40937 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RFC5P40937 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFC5P40937 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms