Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDH1P40925 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDH1P40925 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDH1P40925 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDH1P40925 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDH1P40925 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDH1P40925 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDH1P40925 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDH1P40925 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDH1P40925 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDH1P40925 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDH1P40925 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDH1P40925 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDH1P40925 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDH1P40925 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MDH1P40925 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDH1P40925 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDH1P40925 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDH1P40925 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDH1P40925 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDH1P40925 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDH1P40925 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDH1P40925 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDH1P40925 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MDH1P40925 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDH1P40925 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDH1P40925 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDH1P40925 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDH1P40925 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDH1P40925 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDH1P40925 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDH1P40925 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDH1P40925 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDH1P40925 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDH1P40925 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDH1P40925 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDH1P40925 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDH1P40925 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDH1P40925 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDH1P40925 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH1P40925 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH1P40925 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH1P40925 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH1P40925 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH1P40925 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH1P40925 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH1P40925 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH1P40925 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH1P40925 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH1P40925 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH1P40925 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH1P40925 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH1P40925 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH1P40925 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH1P40925 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDH1P40925 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDH1P40925 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDH1P40925 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDH1P40925 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDH1P40925 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDH1P40925 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MDH1P40925 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDH1P40925 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDH1P40925 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDH1P40925 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDH1P40925 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDH1P40925 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDH1P40925 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDH1P40925 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDH1P40925 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MDH1P40925 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MDH1P40925 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MDH1P40925 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MDH1P40925 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MDH1P40925 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MDH1P40925 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MDH1P40925 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDH1P40925 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDH1P40925 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDH1P40925 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDH1P40925 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDH1P40925 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDH1P40925 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDH1P40925 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDH1P40925 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDH1P40925 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDH1P40925 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDH1P40925 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDH1P40925 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDH1P40925 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDH1P40925 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDH1P40925 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDH1P40925 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDH1P40925 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDH1P40925 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDH1P40925 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDH1P40925 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MDH1P40925 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDH1P40925 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDH1P40925 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms