Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL1P40616 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL1P40616 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL1P40616 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL1P40616 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL1P40616 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL1P40616 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL1P40616 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL1P40616 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL1P40616 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL1P40616 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL1P40616 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL1P40616 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL1P40616 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL1P40616 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL1P40616 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL1P40616 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL1P40616 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL1P40616 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL1P40616 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL1P40616 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL1P40616 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL1P40616 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL1P40616 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL1P40616 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL1P40616 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL1P40616 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL1P40616 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL1P40616 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL1P40616 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL1P40616 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL1P40616 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL1P40616 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL1P40616 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL1P40616 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL1P40616 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL1P40616 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL1P40616 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL1P40616 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL1P40616 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL1P40616 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL1P40616 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL1P40616 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL1P40616 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL1P40616 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL1P40616 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL1P40616 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL1P40616 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARL1P40616 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARL1P40616 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL1P40616 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL1P40616 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL1P40616 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL1P40616 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL1P40616 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL1P40616 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL1P40616 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL1P40616 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL1P40616 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL1P40616 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL1P40616 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL1P40616 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL1P40616 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL1P40616 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL1P40616 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL1P40616 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL1P40616 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL1P40616 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL1P40616 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL1P40616 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL1P40616 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL1P40616 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL1P40616 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL1P40616 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL1P40616 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL1P40616 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL1P40616 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL1P40616 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL1P40616 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL1P40616 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL1P40616 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL1P40616 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL1P40616 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL1P40616 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL1P40616 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL1P40616 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL1P40616 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL1P40616 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL1P40616 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL1P40616 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL1P40616 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL1P40616 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms