Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FEN1P39748 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FEN1P39748 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FEN1P39748 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FEN1P39748 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FEN1P39748 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FEN1P39748 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FEN1P39748 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FEN1P39748 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FEN1P39748 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FEN1P39748 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FEN1P39748 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FEN1P39748 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FEN1P39748 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FEN1P39748 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FEN1P39748 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FEN1P39748 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FEN1P39748 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FEN1P39748 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FEN1P39748 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FEN1P39748 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FEN1P39748 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FEN1P39748 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FEN1P39748 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FEN1P39748 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FEN1P39748 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FEN1P39748 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FEN1P39748 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FEN1P39748 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FEN1P39748 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FEN1P39748 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FEN1P39748 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FEN1P39748 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FEN1P39748 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FEN1P39748 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FEN1P39748 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FEN1P39748 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FEN1P39748 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FEN1P39748 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FEN1P39748 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FEN1P39748 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FEN1P39748 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FEN1P39748 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FEN1P39748 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FEN1P39748 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FEN1P39748 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FEN1P39748 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FEN1P39748 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FEN1P39748 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FEN1P39748 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FEN1P39748 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FEN1P39748 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FEN1P39748 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FEN1P39748 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FEN1P39748 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FEN1P39748 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FEN1P39748 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FEN1P39748 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FEN1P39748 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FEN1P39748 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FEN1P39748 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FEN1P39748 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FEN1P39748 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FEN1P39748 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FEN1P39748 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FEN1P39748 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FEN1P39748 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FEN1P39748 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FEN1P39748 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FEN1P39748 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FEN1P39748 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FEN1P39748 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FEN1P39748 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FEN1P39748 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FEN1P39748 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FEN1P39748 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FEN1P39748 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FEN1P39748 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FEN1P39748 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FEN1P39748 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FEN1P39748 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FEN1P39748 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FEN1P39748 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FEN1P39748 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FEN1P39748 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FEN1P39748 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FEN1P39748 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FEN1P39748 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FEN1P39748 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FEN1P39748 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FEN1P39748 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FEN1P39748 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FEN1P39748 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FEN1P39748 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FEN1P39748 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FEN1P39748 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FEN1P39748 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FEN1P39748 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FEN1P39748 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FEN1P39748 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms