Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPB2P35606 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPB2P35606 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPB2P35606 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPB2P35606 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPB2P35606 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPB2P35606 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPB2P35606 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPB2P35606 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPB2P35606 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPB2P35606 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPB2P35606 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPB2P35606 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPB2P35606 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COPB2P35606 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COPB2P35606 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COPB2P35606 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
COPB2P35606 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPB2P35606 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPB2P35606 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPB2P35606 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPB2P35606 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPB2P35606 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COPB2P35606 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COPB2P35606 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COPB2P35606 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COPB2P35606 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPB2P35606 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPB2P35606 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPB2P35606 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COPB2P35606 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPB2P35606 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPB2P35606 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPB2P35606 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPB2P35606 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COPB2P35606 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPB2P35606 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPB2P35606 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COPB2P35606 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPB2P35606 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPB2P35606 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPB2P35606 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPB2P35606 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPB2P35606 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPB2P35606 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPB2P35606 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPB2P35606 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPB2P35606 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPB2P35606 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPB2P35606 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPB2P35606 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPB2P35606 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPB2P35606 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPB2P35606 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COPB2P35606 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPB2P35606 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPB2P35606 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPB2P35606 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPB2P35606 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPB2P35606 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPB2P35606 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPB2P35606 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPB2P35606 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPB2P35606 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COPB2P35606 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COPB2P35606 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COPB2P35606 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COPB2P35606 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
COPB2P35606 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
COPB2P35606 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COPB2P35606 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COPB2P35606 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPB2P35606 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPB2P35606 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPB2P35606 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPB2P35606 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPB2P35606 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPB2P35606 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPB2P35606 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COPB2P35606 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
COPB2P35606 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COPB2P35606 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COPB2P35606 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COPB2P35606 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPB2P35606 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPB2P35606 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPB2P35606 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPB2P35606 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPB2P35606 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPB2P35606 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPB2P35606 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COPB2P35606 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COPB2P35606 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COPB2P35606 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COPB2P35606 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPB2P35606 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPB2P35606 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPB2P35606 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPB2P35606 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPB2P35606 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms