Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA1P35221 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTNNA1P35221 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNA1P35221 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms