Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFN2P35080 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFN2P35080 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFN2P35080 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFN2P35080 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFN2P35080 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFN2P35080 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFN2P35080 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFN2P35080 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFN2P35080 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFN2P35080 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PFN2P35080 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFN2P35080 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFN2P35080 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFN2P35080 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFN2P35080 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFN2P35080 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFN2P35080 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFN2P35080 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFN2P35080 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFN2P35080 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFN2P35080 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFN2P35080 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFN2P35080 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFN2P35080 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFN2P35080 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFN2P35080 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFN2P35080 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFN2P35080 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFN2P35080 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFN2P35080 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFN2P35080 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFN2P35080 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFN2P35080 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms