Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP2P32456 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP2P32456 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP2P32456 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP2P32456 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP2P32456 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP2P32456 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP2P32456 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP2P32456 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP2P32456 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP2P32456 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP2P32456 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP2P32456 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP2P32456 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP2P32456 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP2P32456 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP2P32456 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP2P32456 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP2P32456 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GBP2P32456 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GBP2P32456 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GBP2P32456 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GBP2P32456 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP2P32456 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP2P32456 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP2P32456 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP2P32456 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP2P32456 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP2P32456 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP2P32456 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP2P32456 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP2P32456 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP2P32456 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP2P32456 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP2P32456 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP2P32456 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP2P32456 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP2P32456 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP2P32456 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP2P32456 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP2P32456 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP2P32456 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP2P32456 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP2P32456 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP2P32456 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP2P32456 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP2P32456 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP2P32456 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP2P32456 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP2P32456 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP2P32456 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP2P32456 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP2P32456 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP2P32456 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP2P32456 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP2P32456 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP2P32456 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP2P32456 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP2P32456 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP2P32456 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP2P32456 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP2P32456 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP2P32456 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP2P32456 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP2P32456 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP2P32456 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP2P32456 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP2P32456 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP2P32456 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP2P32456 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP2P32456 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP2P32456 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP2P32456 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP2P32456 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP2P32456 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP2P32456 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP2P32456 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP2P32456 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP2P32456 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP2P32456 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP2P32456 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP2P32456 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP2P32456 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP2P32456 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP2P32456 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP2P32456 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP2P32456 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GBP2P32456 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP2P32456 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP2P32456 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP2P32456 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP2P32456 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP2P32456 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP2P32456 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP2P32456 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP2P32456 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP2P32456 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP2P32456 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP2P32456 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP2P32456 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms