Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTX2P32243 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTX2P32243 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OTX2P32243 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTX2P32243 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTX2P32243 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTX2P32243 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTX2P32243 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTX2P32243 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTX2P32243 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTX2P32243 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTX2P32243 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTX2P32243 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX2P32243 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTX2P32243 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTX2P32243 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTX2P32243 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTX2P32243 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTX2P32243 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
OTX2P32243 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTX2P32243 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTX2P32243 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTX2P32243 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTX2P32243 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTX2P32243 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTX2P32243 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTX2P32243 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTX2P32243 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTX2P32243 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTX2P32243 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTX2P32243 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTX2P32243 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OTX2P32243 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
OTX2P32243 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX2P32243 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX2P32243 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX2P32243 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX2P32243 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX2P32243 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTX2P32243 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTX2P32243 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTX2P32243 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTX2P32243 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
OTX2P32243 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTX2P32243 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTX2P32243 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTX2P32243 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTX2P32243 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTX2P32243 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTX2P32243 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTX2P32243 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTX2P32243 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTX2P32243 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTX2P32243 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTX2P32243 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTX2P32243 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
OTX2P32243 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTX2P32243 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
OTX2P32243 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
OTX2P32243 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTX2P32243 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTX2P32243 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTX2P32243 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTX2P32243 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTX2P32243 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTX2P32243 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms