Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSPOP30536 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSPOP30536 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSPOP30536 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSPOP30536 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSPOP30536 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSPOP30536 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSPOP30536 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSPOP30536 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSPOP30536 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TSPOP30536 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPOP30536 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPOP30536 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPOP30536 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPOP30536 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPOP30536 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPOP30536 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPOP30536 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPOP30536 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPOP30536 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPOP30536 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms