Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms