Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LMOD1P29536 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD1P29536 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD1P29536 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD1P29536 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD1P29536 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD1P29536 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD1P29536 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD1P29536 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD1P29536 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD1P29536 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD1P29536 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD1P29536 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD1P29536 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD1P29536 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD1P29536 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD1P29536 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD1P29536 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD1P29536 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD1P29536 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD1P29536 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD1P29536 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD1P29536 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD1P29536 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD1P29536 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD1P29536 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD1P29536 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD1P29536 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD1P29536 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD1P29536 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD1P29536 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD1P29536 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD1P29536 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD1P29536 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD1P29536 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD1P29536 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD1P29536 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD1P29536 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD1P29536 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD1P29536 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD1P29536 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD1P29536 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD1P29536 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LMOD1P29536 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LMOD1P29536 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD1P29536 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD1P29536 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD1P29536 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LMOD1P29536 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms