Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL1P28749 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL1P28749 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL1P28749 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL1P28749 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL1P28749 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL1P28749 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL1P28749 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL1P28749 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL1P28749 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL1P28749 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL1P28749 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL1P28749 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL1P28749 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL1P28749 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL1P28749 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL1P28749 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL1P28749 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL1P28749 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL1P28749 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL1P28749 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL1P28749 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL1P28749 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL1P28749 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL1P28749 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL1P28749 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL1P28749 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL1P28749 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL1P28749 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL1P28749 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL1P28749 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL1P28749 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL1P28749 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL1P28749 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL1P28749 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL1P28749 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL1P28749 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL1P28749 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL1P28749 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL1P28749 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL1P28749 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL1P28749 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL1P28749 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL1P28749 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL1P28749 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL1P28749 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL1P28749 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL1P28749 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL1P28749 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL1P28749 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL1P28749 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL1P28749 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL1P28749 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBL1P28749 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBL1P28749 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBL1P28749 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL1P28749 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL1P28749 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL1P28749 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL1P28749 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL1P28749 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL1P28749 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL1P28749 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL1P28749 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL1P28749 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL1P28749 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL1P28749 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL1P28749 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL1P28749 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL1P28749 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL1P28749 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL1P28749 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL1P28749 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL1P28749 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL1P28749 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL1P28749 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL1P28749 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL1P28749 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL1P28749 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL1P28749 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL1P28749 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL1P28749 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL1P28749 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL1P28749 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL1P28749 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL1P28749 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL1P28749 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL1P28749 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL1P28749 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL1P28749 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL1P28749 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL1P28749 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL1P28749 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL1P28749 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL1P28749 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL1P28749 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBL1P28749 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBL1P28749 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBL1P28749 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBL1P28749 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms