Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRR2P28476 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR2P28476 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms