Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms