Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD1P28289 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMOD1P28289 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms