Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNTFRP26992 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms