Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms