Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP11P24347 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP11P24347 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP11P24347 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP11P24347 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP11P24347 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP11P24347 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP11P24347 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP11P24347 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP11P24347 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP11P24347 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP11P24347 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP11P24347 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP11P24347 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP11P24347 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP11P24347 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP11P24347 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP11P24347 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP11P24347 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP11P24347 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP11P24347 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP11P24347 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP11P24347 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP11P24347 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP11P24347 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP11P24347 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP11P24347 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP11P24347 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP11P24347 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP11P24347 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP11P24347 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP11P24347 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP11P24347 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP11P24347 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP11P24347 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP11P24347 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP11P24347 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP11P24347 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP11P24347 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP11P24347 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP11P24347 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP11P24347 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP11P24347 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP11P24347 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP11P24347 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP11P24347 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP11P24347 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP11P24347 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP11P24347 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP11P24347 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP11P24347 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP11P24347 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP11P24347 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP11P24347 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP11P24347 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP11P24347 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP11P24347 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP11P24347 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP11P24347 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP11P24347 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP11P24347 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP11P24347 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP11P24347 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP11P24347 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP11P24347 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP11P24347 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP11P24347 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP11P24347 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP11P24347 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP11P24347 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP11P24347 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP11P24347 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP11P24347 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP11P24347 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP11P24347 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP11P24347 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP11P24347 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP11P24347 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP11P24347 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP11P24347 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP11P24347 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP11P24347 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP11P24347 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP11P24347 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP11P24347 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP11P24347 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP11P24347 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP11P24347 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP11P24347 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP11P24347 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP11P24347 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP11P24347 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP11P24347 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP11P24347 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP11P24347 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP11P24347 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP11P24347 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP11P24347 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP11P24347 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP11P24347 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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