Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2B4P23634 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2B4P23634 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP2B4P23634 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2B4P23634 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2B4P23634 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2B4P23634 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B4P23634 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B4P23634 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B4P23634 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B4P23634 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B4P23634 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B4P23634 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B4P23634 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B4P23634 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms