Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPS6KB1P23443 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms