Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNA5P22460 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA5P22460 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA5P22460 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms