Protein–RNA interactions for Protein: P22459

KCNA4, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA4P22459 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNA4P22459 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNA4P22459 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms