Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NR1D1P20393 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1D1P20393 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms