Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB6AP20340 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms