Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB5AP20339 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms