Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRM3P20309 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms