Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms