Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD53P19397 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD53P19397 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD53P19397 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CD53P19397 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD53P19397 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD53P19397 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD53P19397 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD53P19397 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD53P19397 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD53P19397 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD53P19397 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD53P19397 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD53P19397 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD53P19397 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD53P19397 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD53P19397 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD53P19397 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD53P19397 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD53P19397 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD53P19397 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD53P19397 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD53P19397 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD53P19397 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD53P19397 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD53P19397 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD53P19397 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD53P19397 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD53P19397 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD53P19397 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD53P19397 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD53P19397 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD53P19397 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD53P19397 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD53P19397 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD53P19397 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD53P19397 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD53P19397 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD53P19397 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD53P19397 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD53P19397 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD53P19397 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD53P19397 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD53P19397 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD53P19397 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD53P19397 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD53P19397 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD53P19397 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD53P19397 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD53P19397 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD53P19397 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD53P19397 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD53P19397 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD53P19397 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD53P19397 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD53P19397 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD53P19397 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD53P19397 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD53P19397 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD53P19397 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD53P19397 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD53P19397 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD53P19397 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD53P19397 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD53P19397 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CD53P19397 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD53P19397 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD53P19397 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD53P19397 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD53P19397 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD53P19397 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD53P19397 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD53P19397 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD53P19397 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD53P19397 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD53P19397 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD53P19397 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD53P19397 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD53P19397 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD53P19397 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD53P19397 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD53P19397 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD53P19397 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD53P19397 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD53P19397 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD53P19397 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD53P19397 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD53P19397 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD53P19397 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD53P19397 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CD53P19397 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD53P19397 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD53P19397 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD53P19397 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CD53P19397 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD53P19397 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD53P19397 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD53P19397 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD53P19397 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD53P19397 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms